From T3_KR_KNU
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(Starting GRID Job Submission)
(Storage Element, 데이터 저장장치 사용하기)
 
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== Pre-requisites ==
 
== Pre-requisites ==
  
KNU Tier-2를 이용하기 위해서는 Grid 환경에 접속하기 위한 인증서를 공식 인증 사이트를 통해 획득한 후 LCG VO에 등록하고 KNU Tier-2에 사용계획서 및 유저 등록을 통해 계정을 부여받는다.
+
KNU Tier-3를 이용하기 위해서는 Grid 환경에 접속하기 위한 인증서를 공식 인증 사이트를 통해 획득한 후 LCG VO에 등록하고 KNU Tier-3에 사용계획서 및 유저 등록을 통해 계정을 부여받는다.
  
1. CERN 및 CMS User 등록
+
=== CERN 및 CMS User 등록 ===
 
   [[CERN_&_CMS_User_Registration|CERN & CMS User Registration]]
 
   [[CERN_&_CMS_User_Registration|CERN & CMS User Registration]]
  
2. Certificate
+
=== VO(Virtual Organisation) 등록 ===
  [https://ca.cern.ch/ca/ CERN 인증서 웹사이트]에 접속하여 Certificate를 발급받는다.
+
  CERN Certificate를 다운로드 받은 웹브라우저(인증서가 import 되어 있는)로
 +
  [https://voms2.cern.ch:8443/voms/cms/register LCG CMS VO]에 접속하여 인증서를 등록. ([https://twiki.cern.ch/twiki/bin/view/CMSPublic/SWGuideLcgAccess#How_to_register_in_the_CMS_VO 참고: VO 등록방법 안내 자료])
 +
  이메일등 신상 정보를 입력하고, role을 선택한 후 신청서를 제출하면, 담당자가 등록 결과를 이메일로 보내줌. [https://voms2.cern.ch:8443/voms/cms CMS VO 등록 여부 확인 홈페이지]
  
  Certificate가 발급되면 인증서를 개인 PC 웹브라우저에 Import 한 후,
+
=== <span style="color:#FF0000">'''Getting KNU Tier-3 Account'''</span> ===
  Import된 인증서를 웹브라우저 설정 메뉴 중 Public key 관련탭에서 개인 PC로 Export할 수 있다.
+
  (인증서를 Export할 시 확장자는 ".Pfx"로 선택하시기 바랍니다.)
+
  
  Export된 인증서 파일은 cms UI(cms.knu.ac.kr)의 본인 디렉토리에 복사한 후
+
  '''1) [http://t2-cms.knu.ac.kr/lcg_registration.php KNU Account Registration 웹페이지]에서 신청서를 작성, 제출한다.'''
  아래의 순서대로 인증서와 키를 만들어 .globus 디렉토리에 넣으시기 바랍니다.
+
   '''2) [http://t2-cms.knu.ac.kr/upload/Tier3_KR_KNU.hwp 사용계획서(hwp)]를 작성하여 e-mail(lcg_knu@knu.ac.kr)로 발송한다.'''
   $ mkdir .globus
+
   '''
  $ openssl pkcs12 -in usercert.pfx -clcerts -nokeys -out .globus/usercert.pem
+
  $ openssl pkcs12 -in usercert.pfx -nocerts -out .globus/userkey.pem
+
   $ chmod 644 .globus/usercert.pem
+
  $ chmod 400 .globus/userkey.pem
+
  
3. VO(Virtual Organisation) 등록
+
   ''' 발급 받은 임시 비밀번호를 이용해 KNU Tier-3 UI에 접속합니다. (임시 비밀번호는 "passwd"명령을 이용하여 반드시 변경하십시오)
   CERN Certificate를 다운로드 받은 웹브라우저(인증서가 import 되어 있는)로
+
   '''  
  [https://lcg-voms.cern.ch:8443/vo/cms/vomrs?path=/RootNode LCG CMS VO]에 접속하여 인증서를 등록. ([https://twiki.cern.ch/twiki/bin/view/CMSPublic/SWGuideLcgAccess#How_to_register_in_the_CMS_VO 참고: VO 등록방법 안내 자료])
+
  '''$ ssh userid@kcms-t2.knu.ac.kr
   이메일등 신상 정보를 입력하고, role을 선택한 후 신청서를 제출하면, 담당자가 등록 결과를 이메일로 보내줌. [https://voms.cern.ch:8443/voms/cms CMS VO 등록 여부 확인 홈페이지]
+
 
+
4. <span style="color:#FF0000">'''Getting KNU Tier-2 Account'''</span>
+
  
 
   ''' <<Account 발급 전, 자주 하는 질문>>
 
   ''' <<Account 발급 전, 자주 하는 질문>>
 +
  '' Q : 사용계획서는 왜 적어야 하나요?
 +
  ''' A : 사용계획서를 통하여 연구자들에게 필요한 전산 자원을 가늠하고 그에 따른 준비를 할 수 있습니다.
 +
  '''
 
   '' Q : CMS에서 처음 일하게 되어 전반적인 연구 내용을 잘 모릅니다. 신청서 내용 작성에 어려움이 많습니다. 어떻게 하면 좋을까요?
 
   '' Q : CMS에서 처음 일하게 되어 전반적인 연구 내용을 잘 모릅니다. 신청서 내용 작성에 어려움이 많습니다. 어떻게 하면 좋을까요?
 
   ''' A : CMS 신규 사용자의 경우 연구 내용을 잘 모를 수 있고, 컴퓨팅 자원에 대한 지식이 부족할 수 있습니다.
 
   ''' A : CMS 신규 사용자의 경우 연구 내용을 잘 모를 수 있고, 컴퓨팅 자원에 대한 지식이 부족할 수 있습니다.
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   ''
 
   ''
 
   '' Q : 연구 계획서에서 앞으로 사용할 (CPU, Disk) 사용량을 적어 냈는데요, 반드시 이 범위 내에서만 사용해야 하나요?
 
   '' Q : 연구 계획서에서 앞으로 사용할 (CPU, Disk) 사용량을 적어 냈는데요, 반드시 이 범위 내에서만 사용해야 하나요?
   ''' A : 연구를 진행하시면서 연구 계획이 구체화되고 이에 따라 자원의 필요량이 증가하시면, Tier-2 연락처를 통해 미리 말씀해 주시면 필요한 자원의 할당을 준비해 드리겠습니다.
+
   ''' A : 연구를 진행하시면서 연구 계획이 구체화되고 이에 따라 자원의 필요량이 증가하시면, Tier-3 연락처를 통해 미리 말씀해 주시면 필요한 자원의 할당을 준비해 드리겠습니다.
 
   '''    대량의 연구자원을 갑작스럽게 요청하시면 자원 할당에 시간이 다소 소요될 수 있습니다.
 
   '''    대량의 연구자원을 갑작스럽게 요청하시면 자원 할당에 시간이 다소 소요될 수 있습니다.
 
   ''
 
   ''
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   '' Q : 연구의 내용이 확장되어 더 많은 자원을 필요로 합니다. 이런 경우 어떻게 해야 하나요?
 
   '' Q : 연구의 내용이 확장되어 더 많은 자원을 필요로 합니다. 이런 경우 어떻게 해야 하나요?
 
   ''' A : 연구계획 수정 내용을 추가로 작성/제출하시면 됩니다.
 
   ''' A : 연구계획 수정 내용을 추가로 작성/제출하시면 됩니다.
   '''    Tier-2 에서 보유하고 있는 여유 전산자원에 따라, 필요하신 자원의 준비에 다소 시간이 소요될 수 있으니 시간적 여유를 두시고 신청해 주시면 감사하겠습니다.
+
   '''    Tier-3 에서 보유하고 있는 여유 전산자원에 따라, 필요하신 자원의 준비에 다소 시간이 소요될 수 있으니 시간적 여유를 두시고 신청해 주시면 감사하겠습니다.
 
   '''
 
   '''
 
   ''' (기타 궁금하신 부분이 있으시면 언제든 연락 주시면 안내해 드리겠습니다.)
 
   ''' (기타 궁금하신 부분이 있으시면 언제든 연락 주시면 안내해 드리겠습니다.)
  
  '''1) [http://t2-cms.knu.ac.kr/lcg_registration.php KNU Account Registration 웹페이지]에서 신청서를 작성, 제출한다.'''
+
=== Certificate ===
  '''2) [http://t2-cms.knu.ac.kr/upload/Tier2_KR_KNU.hwp 사용계획서(hwp)]를 작성하여 e-mail(lcg_knu@knu.ac.kr)로 발송한다.'''
+
  [https://ca.cern.ch/ca/ CERN 인증서 웹사이트]에 접속하여 Certificate를 발급받는다.
  '''
+
  발급 받은 임시 비밀번호를 이용해 KNU Tier-2 UI에 접속한 후 그리드 프록시가 정상적으로 생성되는지 확인한다.
+
  (임시 비밀번호는 [http://cluster176.knu.ac.kr/wiki/index.php?title=How_to_use_Tier2_at_KNU#KNU_Tier-2_Login 아래 안내문]을 참고해서 반드시 변경하십시오)
+
  $ voms-proxy-init --voms cms
+
  Your identity: '''''/DC=ch/DC=cern/OU=Organic Units/OU=Users/CN=XXXXXXXX'''''    <--------- DN(distinguished name)
+
  
5. SiteDB 등록
+
  Certificate가 발급되면 인증서를 개인 PC 웹브라우저에 Import 한 후,
  '''CRAB 이용을 위한 필수 과정인 사용자 DN의 SiteDB 등록이 자동화 됨.'''
+
  Import된 인증서를 웹브라우저 설정 메뉴 중 Public key 관련탭에서 개인 PC로 Export할 수 있다.  
 +
  (인증서를 Export할 시 확장자는 ".Pfx"로 선택하시기 바랍니다.)
  
   - 관련 안내 자료
+
  Export된 인증서 파일은 cms UI(cms.knu.ac.kr)의 본인 디렉토리에 복사한 후
    SiteDB for CRAB: https://twiki.cern.ch/twiki/bin/view/CMS/SiteDBForCRAB
+
  아래의 순서대로 인증서와 키를 만들어 .globus 디렉토리에 넣으시기 바랍니다.
    사용자 DN 등록 자동화 안내 : https://twiki.cern.ch/twiki/bin/viewauth/CMS/SiteDBForCRAB#Adding_your_DN_to_your_profile
+
   $ mkdir .globus
 +
  $ openssl pkcs12 -in usercert.pfx -clcerts -nokeys -out .globus/usercert.pem
 +
  $ openssl pkcs12 -in usercert.pfx -nocerts -out .globus/userkey.pem
 +
  $ chmod 644 .globus/usercert.pem
 +
  $ chmod 400 .globus/userkey.pem
  
== KNU Tier-2 Login ==
+
== KNU Tier-3 Login ==
 
+
1. Linux 에서 접속하기
+
터미널을 열어서 원격로그인(SSH)으로 접속한다.
+
ssh -X username@kcms-t2.knu.ac.kr( or username@cms.knu.ac.kr, username@cms01.knu.ac.kr)
+
2. Windows OS 에서 접속하기
+
Windows OS 에서 linux 서버로 접속하려면 원격 로그인을 사용할 수 있는 특정 프로그램이 필요하다.
+
    예) [http://www.chiark.greenend.org.uk/~sgtatham/putty/ '''Putty'''(무료)], '''SSH Secure Shell Client''' (프리웨어 또는 정식 서비스를 찾아 설치가능) - [[SSH_Secure_Shell_Client_의_경우|SSH Secure Shell Client 예시 화면]]
+
또한, Event display 및 ROOT을 사용하기 위해서는 다음과 같은 X 서버를 별도로 설치하여야 한다.
+
    예) [http://sourceforge.net/projects/xming/ '''Xming'''(무료)], [http://x.cygwin.com/screenshots/ '''Cygwin/X'''(무료)], '''Hummingbird'''(유료), '''Xmanager'''(유료)
+
 
+
* 첫 로그인 후 개인 Password 및 shell 설정시 유의사항
+
1) 패스워드 변경시 passwd 명령을 사용.
+
$ passwd
+
 
+
<span style="color:#FF0000">[주의 : 비밀번호 변경은 더이상 yppasswd 명령을 사용하지 않습니다.]</span>
+
 
+
2) Login Password는 알파벳, 숫자, 특수문자 등을 섞어서 사용하여 기억하기 쉬우면서도 길게 만드는 것이 해킹방지에 용의하다.
+
    (간단한 단어 또는 숫자만의 조합은 극히 위험함.)
+
 
+
3) 계정이 발급되었을때 처음 기본 쉘은 tcsh 이다. 기본 shell의 변경은 ypchsh 명령을 이용하여 bash 혹은 zsh 등의 자신이 선호하는 shell로 변경할 수 있다.
+
$ ypchsh
+
  
3. KNU UI 현황
+
=== KNU UI 현황 ===
 
{| style="background:#cccc99;color:#black;white:80%;" border="1" cellpadding="5" cellspacing="0"
 
{| style="background:#cccc99;color:#black;white:80%;" border="1" cellpadding="5" cellspacing="0"
!  대표 Hostname  !! 세부 Hostname !! OS !! 비고
+
!  대표 Hostname  !! 세부 Hostname !! OS !! 접속방법 !! 비고
 
|- style="background:white; color:black"
 
|- style="background:white; color:black"
 
! kcms-t2.knu.ac.kr
 
! kcms-t2.knu.ac.kr
 
| cms.knu.ac.kr
 
| cms.knu.ac.kr
| SL6
+
| CentOS7
| Tier2 UI
+
| ssh,mosh,x2go,jupyterhub
 +
| Tier3 UI, HTCondor
 
|- style="background:#f0f0f0; color:black"
 
|- style="background:#f0f0f0; color:black"
 
! kcms-t2.knu.ac.kr
 
! kcms-t2.knu.ac.kr
 
| cms01.knu.ac.kr
 
| cms01.knu.ac.kr
| SL6
+
| CentOS7
| Tier2 UI
+
| ssh,mosh,x2go
 +
| Tier3 UI, HTCondor
 
|- style="background:white; color:black"
 
|- style="background:white; color:black"
 
! kcms-t3.knu.ac.kr
 
! kcms-t3.knu.ac.kr
 
| cms02.knu.ac.kr
 
| cms02.knu.ac.kr
| SL6
+
| CentOS7
| Tier3 UI  
+
| ssh,mosh,x2go
 +
| Tier3 UI, HTCondor
 
|- style="background:#f0f0f0; color:black"
 
|- style="background:#f0f0f0; color:black"
 
! kcms-t3.knu.ac.kr
 
! kcms-t3.knu.ac.kr
 
| cms03.knu.ac.kr
 
| cms03.knu.ac.kr
| SL5
+
| CentOS7
| Tier3 UI
+
| ssh,mosh,x2go
 +
| Tier3 U, HTCondor
 
|}
 
|}
  
 
<p>
 
<p>
  
== CMSSW(CMS Software) Installation ==
+
=== ssh ===
  
* CMSSW 을 설치하기 위해 먼저 설치 환경을 설정한다.  
+
==== Linux에서 ssh로 UI에 접속하기 ====
  $ source /cvmfs/cms.cern.ch/cmsset_default.csh
+
터미널을 열어서 원격로그인(SSH)으로 접속한다.  
 +
  $ ssh -X username@kcms-t2.knu.ac.kr( or username@cms.knu.ac.kr, username@cms01.knu.ac.kr)
 +
$ ssh -X username@kcms-t3.knu.ac.kr( or username@cms02.knu.ac.kr, username@cms03.knu.ac.kr)
  
bash shell을 사용한다면
+
==== Windows OS에서 ssh로 UI에 접속하기 ====
  $ source /cvmfs/cms.cern.ch/cmsset_default.sh
+
  Windows OS 에서 linux 서버로 접속하려면 원격 로그인을 사용할 수 있는 특정 프로그램이 필요하다.
 +
    예) [http://www.chiark.greenend.org.uk/~sgtatham/putty/ '''Putty'''(무료)], '''SSH Secure Shell Client''' (프리웨어 또는 정식 서비스를 찾아 설치가능) - [[SSH_Secure_Shell_Client_의_경우|SSH Secure Shell Client 예시 화면]]
 +
또한, Event display 및 ROOT을 사용하기 위해서는 다음과 같은 X 서버를 별도로 설치하여야 한다.
 +
    예) [http://sourceforge.net/projects/xming/ '''Xming'''(무료)], [http://x.cygwin.com/screenshots/ '''Cygwin/X'''(무료)], '''Hummingbird'''(유료), '''Xmanager'''(유료)
  
설치하고자 하는 버전의 CMSSW 를 확인한 후 개인 <working-directroy> 로 이동하여 설치한다. (x.y.z 는 버전을 나타낸다)
+
* 첫 로그인 후 개인 Password 및 shell 설정시 유의사항
  $ scramv1 list CMSSW
+
  1) 패스워드 변경시 passwd 명령을 사용.
$ cd <working-directory>
+
  $ passwd
  $ scramv1 project CMSSW CMSSW_x_y_z
+
  
== CRAB(CMS Remote Analysis Builder) Installation ==
+
<span style="color:#FF0000">[주의 : 비밀번호 변경은 더이상 yppasswd 명령을 사용하지 않습니다.]</span>
  
[https://twiki.cern.ch/twiki/bin/view/CMSPublic/SWGuideCrab CRAB online manual and tutorial]
+
2) Login Password는 알파벳, 숫자, 특수문자 등을 섞어서 사용하여 기억하기 쉬우면서도 길게 만드는 것이 해킹방지에 도움이 됩니다.
 +
    (간단한 단어 또는 숫자만의 조합은 극히 위험함.)
  
1. CMS Crab 사용 가이드를 참고하여 Crab을 설치합니다.
+
3) 계정이 발급되었을때 처음 기본 쉘은 tcsh 이다. 기본 shell의 변경은 ypchsh 명령을 이용하여 bash 혹은 zsh 등의 자신이 선호하는 shell로 변경할 수 있다.
 +
$ ypchsh
  
2. configure 파일을 설정하여 crab 작업을 실행한다.
+
=== ssh 보다 편리한 mosh ===
  
3. crab 작업 실행 상황을 모니터링한다.
+
* [[mosh|mosh 소개 및 사용법]]
  
$ cd <working-directory>
+
=== 원격 데스크탑 접속이 필요하다면 x2go ===
$ crab submit -c crab3config.py
+
$ crab status
+
  
== Setting Environment ==
+
* [[x2go|x2go를 이용한 원격데스크탑 가이드]]
$ source /cvmfs/cms.cern.ch/cmsset_default.csh
+
* CMSSW 5_X_X 버전(64 bit)을 사용하기 위해서는 아래 환경설정을 추가로 입력
+
$ set SCRAM_ARCH=slc5_amd64_gcc462
+
  
* 환경 설정시 필수 유의사항
+
=== JupyterHub ===
  1. CMSSW 환경 설정은 '''반드시''' CMSSW_x_y_z directory 아래에서 시행되어야한다.
+
2. CRAB을 사용하는 경우 환경 설정 순서는 '''반드시''' CMSSW 환경설정을 우선하여 시행한다.
+
  
CMSSW 환경 설정
+
* [[JupyterHub|JupyterHub 사용법 ]]
$ cd /cvmfs/cms.cern.ch/slc5_amd64_gcc462/cms/cmssw/CMSSW_x_y_z
+
$ cmsenv (= eval `scramv1 runtime -csh`)
+
  
== Starting GRID Job Submission ==
+
== Computing Element, 연산 자원 사용하기 ==
  
CRAB3 사용 및 간단한 명령어
+
=== Grid 작업을 위한 CRAB Tutorial ===
  
$ cd <working-directory>/CMSSW_x_y_z/src/<data-directory>
+
* [[crab | Crab tutorial 항목을 참고하세요. ]]
$ voms-proxy-init --voms cms
+
    
      예)Your proxy is valid until Tue Apr 22 06:03:51 KST 2014
+
=== 배치 작업(HTCondor) 실행하기 ===
 
+
[[HTCondor|HTCondor Batch System 사용법 페이지로 바로 가기]]
CRAB 기본 명령어    
+
$ crab submit -c crab3config.py  (Grid job 생성 및 submit)  
+
$ crab status          (수행중인 job 의 상태 확인)
+
  
== How to use KNU Tier-3 ==
+
=== HTCondor에서 GPU 사용하기 ===
 +
[[HTCondorGPU|HTCondor에서 GPU 사용하기 페이지로 바로 가기]]
  
 +
=== create-batch 사용하기 ===
 +
[[Create-batch|create-batch 사용법으로 바로 가기]]
  
1. KNU Tier-3 이용
+
== Storage Element, 데이터 저장장치 사용하기 ==
  Tier-3 Farm은 Tier-2 에 비해서 상대적으로 작은 연산자원을 가지고 있습니다. 많은 양의 job 혹은 무거운 job의 실행은 Tier-2를 이용해 주시기 바랍니다.
+
  추후 자원 증설 예산을 최대한 반영하여 자원 확보에 노력하겠습니다.
+
  
2. Grid 환경에서 작업 실행하기
+
=== Storage Element Tutorial ===
  기본적인 작업 실행 방법은 기존 Tier-2의 방법과 동일합니다.
+
  다만, Crab 설정에서
+
  '''[GRID]'''
+
  '''ce_white_list = cluster118.knu.ac.kr'''
+
  을 추가해 주시면 Tier-3 Farm에 작업이 할당됩니다.
+
 
+
3. 배치 작업(Torque) 실행하기
+
  1) Tier-3 UI 접속하기
+
    터미널을 열어서 원격로그인(SSH)으로 접속한다.
+
    ssh -X username@kcms-t3.knu.ac.kr( or username@cms02.knu.ac.kr)
+
  2) 작업 실행하기
+
    ① 쉘을 bash로 전환한다.
+
        '''bash'''
+
    ② SCRAM_ARCH를 slc5로 설정한다.
+
        '''export SCRAM_ARCH=slc5_ia32_gcc434'''
+
    ③ cms 환경을 설정한다.
+
        '''source /cvmfs/cms.cern.ch/cmsset_default.csh'''
+
    ④ 자신이 작업하고자 하는 CMSSW이 설치된 폴더로 이동한다.
+
        '''cd CMSSW_version/src'''
+
    ⑤ 실행할 파일을 확인한다.
+
        '''scram runtime -sh'''
+
    ⑥ 자신에게 맞는 CMSW 버전, 작업 디렉토리, 결과 저장 디렉토리, 이메일 주소 등을 job_template_cmssw에 기록한다. (job_template_cmssw 파일은 작업 할당 폴더에 위치 시킨다.)
+
        참조 : http://www.physics.purdue.edu/Tier2/files/job_template_cmssw.txt
+
    ⑦ createjobs 파일을 생성하고 읽기, 쓰기, 실행 권한을 부여한다.
+
        참조 : http://www.physics.purdue.edu/Tier2/files/createjobs.txt
+
    ⑧ 작업을 실행(submit)한다.
+
        '''./createjobs.sh jobname #event #job #submitjob cfgfilename nameofcluster'''
+
    ⑨ 실행(submit)한 작업의 상태를 관찰한다.
+
        '''qstat cms'''
+
  '''※주의 : 배치 작업(Torque) 실행은 Tier-3에서만 가능합니다.'''
+
  
== CRAB Feedback & CMS Computing Manual ==
+
[[Storage_Element_Tutorial| Storage Element Tutorial 페이지로 가기]]
* CRAB 사용시 발생하는 문제점 및 해결방법은 아래 사이트를 참조
+
https://hypernews.cern.ch/HyperNews/CMS/get/crabFeedback.html
+
* CMS Computing Manual
+
https://twiki.cern.ch/twiki/bin/view/CMSPublic/WorkBook
+
  
== Storage Element (SE) Manual ==
+
=== xrootd 를 활용한 SE Data 사용 가이드 ===
CRAB 등을 사용하여 얻은 데이터를 보관할 수 있는 저장 공간을 Storage Element (SE)라 한다.
+
이곳에 데이터를 저장하기 위해서는 몇가지 특수한 명령어를 사용해야 한다.
+
  
<span style="color:#FF0000">[주의 : tcsh, csh 등 에서 관련 명령어를 사용할 때, 경로 인자에 반드시 " " 사용해주시기 바랍니다.
+
[[Xrootd| xrootd 활용한 SE Data 사용 가이드 페이지로 가기]]
]</span>
+
  
 +
=== dCache에서 WebDav 프로토콜 및 MACAROONS 인증 사용하기 ===
  
1) voms 인증 후 사용할수 있다.
+
[[WebDav| dCache에서 WebDav 프로토콜 및 MACAROONS 인증 사용하기 페이지로 가기]]
$ voms-proxy-init --voms cms
+
  
2) SE의 사용자 디렉토리
+
=== dcap 프로토콜을 이용하여 SE 사용하기 ===
$ srm://cluster142.knu.ac.kr:8443/srm/managerv2?SFN=/pnfs/knu.ac.kr/data/cms/store/user/(username)
+
  
3) 로컬 디렉토리의 test.file 파일을  SE의 사용자 디렉토리로 복사하기
+
[[Dcap| dcap을 이용하여 SE 사용하기 페이지로 가기]]
  
$ gfal-copy srm://cluster142.knu.ac.kr:8443/.../SrcFile    srm://cluster142.knu.ac.kr:8443/.../DestFile
+
=== CMS Dataset 전송을 위한 Rucio 사용법 ===
$ gfal-copy srm://cluster142.knu.ac.kr:8443/.../SrcFile    file:////u/user/DestFile
+
$ gfal-copy gsidcap://cluster142.knu.ac.kr:8443/.../SrcFile    file:////u/user/DestFile
+
  
4) xrootd 를 활용한 SE Data 접근 방법
+
[[Rucio| Rucio 사용법 페이지로 가기]]
$ xrdcp root://cluster142.knu.ac.kr//store/user/(username)/test.file /some/local/path/test.file
+
  (참조 : http://xrootd.org/doc/prod/Syntax_config.htm)
+
  
5) root에서 SE Data 접근 방법
+
=== WebFTS 사용법 ===
$ TFile *f = TFile::Open("dcap://cluster142.knu.ac.kr//pnfs/knu.ac.kr/data/cms/store/user/(username)/test.root");
+
  
 +
[[Webfts| WebFTS 사용법 페이지로 가기]]
  
6) 복수의 파일을 동시에 전송하기
+
== 응용 소프트웨어 사용 ==
$ /usr/local/bin/lcgcp_copyfiles list.txt
+
  
$ cat  list.txt
+
=== CMSSW(CMS Software) Installation ===
srm://myhost.mydomain.edu:8443//dir1/dir2/sh-copy1 file:///localdir/sh1
+
srm://myhost.mydomain.edu:8443//dir1/dir2/sh-copy2 file:///localdir/sh2
+
srm://myhost.mydomain.edu:8443//dir1/dir2/sh-copy3 file:///localdir/sh3
+
* lcg_cp는 기본적으로 복수파일 전송을 지원하지 않으나 원본경로 대상경로를 포함하는 목록 파일을 생성한뒤, 위의 스크립트를 사용하면 복수의 파일을 전송할수 있다.
+
  
7) 복사가 정상적으로 이루어졌는지 확인 또는 디렉토리의 목록 확인
+
* CMSSW 을 설치하기 위해 먼저 설치 환경을 설정한다.
 +
$ source /cvmfs/cms.cern.ch/cmsset_default.csh
  
  $ gfal-ls -Hl srm://cluster142.knu.ac.kr:8443/srm/managerv2?SFN=/pnfs/knu.ac.kr/data/cms/store/user/(username)
+
bash shell을 사용한다면
 +
  $ source /cvmfs/cms.cern.ch/cmsset_default.sh
  
8) 파일 또는 디렉토리 삭제
+
설치하고자 하는 버전의 CMSSW 를 확인한 후 개인 <working-directroy> 로 이동하여 설치한다. (x.y.z 는 버전을 나타낸다)
  
  $ gfal-rm srm://cluster142.knu.ac.kr:8443/srm/managerv2?SFN=/pnfs/knu.ac.kr/data/cms/store/user/(username)/test/test.file
+
  $ scramv1 list CMSSW
  $ <strike>gfal-rm srm://cluster142.knu.ac.kr:8443/srm/managerv2?SFN=/pnfs/knu.ac.kr/data/cms/store/user/(username)/test</strike>
+
  $ cd <working-directory>
  $ lcg-del -d srm://cluster142.knu.ac.kr:8443/srm/managerv2?SFN=/pnfs/knu.ac.kr/data/cms/store/user/(username)/test
+
  $ scramv1 project CMSSW CMSSW_x_y_z
* 저장공간은 모든 유저들이 공유하는 공간이므로 절대 다른 유저의 디렉토리를 함부로 건드려서는 안된다. (작업은 반드시 사용자의 디렉토리에서 )
+
* 너무 오랜기간 파일들을 방치함으로써 저장공간을 포화상태로 만들어서는 안된다.
+
  
9) gfal 명령어 사용 요약
+
=== CVMFS에 이미 설치되어 있는 소프트웨어 사용하기 ===
  $ voms-proxy-init --voms cms 로 proxy 생성후 아래 명령어를 수행하시면 됩니다.
+
  $ 조회 : gfal-ls -Hl srm://cluster142.knu.ac.kr:8443/srm/managerv2?SFN=/pnfs/knu.ac.kr/data/cms/store/user/MyAccount/FolderName
+
  $ 복사 : gfal-copy srm://cluster142.knu.ac.kr:8443/.../FileNameSrc    srm://cluster142.knu.ac.kr:8443/.../FileNameDest
+
  $ 삭제 : gfal-rm srm://cluster142.knu.ac.kr:8443/srm/managerv2?SFN=/pnfs/knu.ac.kr/data/cms/store/user/MyAccount/FolderName/FileName
+
  $ 디렉토리 삭제 : <strike>gfal-rm -R srm://cluster142.knu.ac.kr:8443/srm/managerv2?SFN=/pnfs/knu.ac.kr/data/cms/store/user/MyAccount/FolderName</strike>
+
* 명령어 뒤의 Option은 매뉴얼 페이지를 참고 바랍니다. (ex. man gfal-ls)
+
  
10) no match 오류가 발생할때
+
==== CVMFS 에서 geant4 사용하기 ====
  
* tcsh에서 ?는 wild card로 인식이 됩니다. 따라서 tcsh을 사용하고 있다면 srm 경로에 반드시 ""를 사용해야 합니다.
+
[[Cvmfs_geant4|CVMFS 에서 geant4 사용하기 페이지로 바로 가기]]
  
11) srm*, lcg*, gfal* 주요 명령어 비교표
+
==== CVMFS 에서 root 사용하기 ====
  
{| style="background:#cccc99;color:#black;white:80%;" border="1" cellpadding="5" cellspacing="0"
+
[[Cvmfs_root|CVMFS 에서 root 사용하기 페이지로 바로 가기]]
!  srm*  !! lcg* !! gfal* !! 비고
+
|- style="background:white; color:black"
+
| srmls
+
| lcg-ls
+
| gfal-ls
+
| ls
+
|- style="background:#f0f0f0; color:black"
+
| srmcp
+
| lcg-cp
+
| goal-copy
+
| cp
+
|- style="background:white; color:black"
+
| srmrm
+
| lcg-del
+
| gfal-rm
+
| rm
+
|- style="background:#f0f0f0; color:black"
+
| srmmkdir
+
|
+
| gfal-mkdir
+
| mkdir
+
|- style="background:white; color:black"
+
| srmrmdir
+
| lcg-del -d
+
| <strike>gfal-rm -R</strike>
+
| rmdir
+
|- style="background:#f0f0f0; color:black"
+
|
+
|
+
| gfal-cat
+
| cat
+
  
|}
+
==== CVMFS에서 원하는 버전의 gcc 사용하기 ====
 +
 
 +
[[Cvmfs_gcc|CVMFS에서 원하는 버전의 gcc 사용하기 페이지로 바로 가기]]
 +
 
 +
==== CVMFS SFT repository 사용법 ====
 +
 
 +
[[SFT|CVMFS SFT repository 사용법 페이지로 바로 가기]]
 +
 
 +
=== HPC를 위한 컨테이너 시스템 Singularity 사용법 ===
 +
 
 +
[[Singularity|Singularity 사용법 페이지로 바로 가기]]

Latest revision as of 02:59, 27 July 2022

Pre-requisites

KNU Tier-3를 이용하기 위해서는 Grid 환경에 접속하기 위한 인증서를 공식 인증 사이트를 통해 획득한 후 LCG VO에 등록하고 KNU Tier-3에 사용계획서 및 유저 등록을 통해 계정을 부여받는다.

CERN 및 CMS User 등록

 CERN & CMS User Registration

VO(Virtual Organisation) 등록

  CERN Certificate를 다운로드 받은 웹브라우저(인증서가 import 되어 있는)로
  LCG CMS VO에 접속하여 인증서를 등록. (참고: VO 등록방법 안내 자료)
  이메일등 신상 정보를 입력하고, role을 선택한 후 신청서를 제출하면, 담당자가 등록 결과를 이메일로 보내줌. CMS VO 등록 여부 확인 홈페이지

Getting KNU Tier-3 Account

  1) KNU Account Registration 웹페이지에서 신청서를 작성, 제출한다.
  2) 사용계획서(hwp)를 작성하여 e-mail(lcg_knu@knu.ac.kr)로 발송한다.
  
   발급 받은 임시 비밀번호를 이용해 KNU Tier-3 UI에 접속합니다. (임시 비밀번호는 "passwd"명령을 이용하여 반드시 변경하십시오)
   
  $ ssh userid@kcms-t2.knu.ac.kr
   <<Account 발급 전, 자주 하는 질문>>
   Q : 사용계획서는 왜 적어야 하나요?
   A : 사용계획서를 통하여 연구자들에게 필요한 전산 자원을 가늠하고 그에 따른 준비를 할 수 있습니다.
  
   Q : CMS에서 처음 일하게 되어 전반적인 연구 내용을 잘 모릅니다. 신청서 내용 작성에 어려움이 많습니다. 어떻게 하면 좋을까요?
   A : CMS 신규 사용자의 경우 연구 내용을 잘 모를 수 있고, 컴퓨팅 자원에 대한 지식이 부족할 수 있습니다.
       사용계획서 내의 예시를 보시고 작성하실 수 있는 부분을 간략히 적으시면 됩니다.
       잘 모르는 부분은 빈란으로 두셔도 되지만, 가능하다면 연구실 선임께 여쭤보시는 방법도 좋습니다.
  
   Q : 연구 계획서에서 앞으로 사용할 (CPU, Disk) 사용량을 적어 냈는데요, 반드시 이 범위 내에서만 사용해야 하나요?
   A : 연구를 진행하시면서 연구 계획이 구체화되고 이에 따라 자원의 필요량이 증가하시면, Tier-3 연락처를 통해 미리 말씀해 주시면 필요한 자원의 할당을 준비해 드리겠습니다.
       대량의 연구자원을 갑작스럽게 요청하시면 자원 할당에 시간이 다소 소요될 수 있습니다.
  
   Q : 초기에 제출한 전산자원 사용량을 초과하여 사용할 경우 불익이 있나요?
   A : 개인 용량을 다소 초과하셔도 불익은 없습니다. 다만 추가 사용량이 큰 경우 협의를 통해 조정하시기 바랍니다.
  
   Q : 연구의 내용이 확장되어 더 많은 자원을 필요로 합니다. 이런 경우 어떻게 해야 하나요?
   A : 연구계획 수정 내용을 추가로 작성/제출하시면 됩니다.
       Tier-3 에서 보유하고 있는 여유 전산자원에 따라, 필요하신 자원의 준비에 다소 시간이 소요될 수 있으니 시간적 여유를 두시고 신청해 주시면 감사하겠습니다.
  
   (기타 궁금하신 부분이 있으시면 언제든 연락 주시면 안내해 드리겠습니다.)

Certificate

 CERN 인증서 웹사이트에 접속하여 Certificate를 발급받는다.  
 Certificate가 발급되면 인증서를 개인 PC 웹브라우저에 Import 한 후, 
 Import된 인증서를 웹브라우저 설정 메뉴 중 Public key 관련탭에서 개인 PC로 Export할 수 있다. 
 (인증서를 Export할 시 확장자는 ".Pfx"로 선택하시기 바랍니다.) 
 Export된 인증서 파일은 cms UI(cms.knu.ac.kr)의 본인 디렉토리에 복사한 후
 아래의 순서대로 인증서와 키를 만들어 .globus 디렉토리에 넣으시기 바랍니다.
  $ mkdir .globus
  $ openssl pkcs12 -in usercert.pfx -clcerts -nokeys -out .globus/usercert.pem
  $ openssl pkcs12 -in usercert.pfx -nocerts -out .globus/userkey.pem
  $ chmod 644 .globus/usercert.pem
  $ chmod 400 .globus/userkey.pem

KNU Tier-3 Login

KNU UI 현황

대표 Hostname 세부 Hostname OS 접속방법 비고
kcms-t2.knu.ac.kr cms.knu.ac.kr CentOS7 ssh,mosh,x2go,jupyterhub Tier3 UI, HTCondor
kcms-t2.knu.ac.kr cms01.knu.ac.kr CentOS7 ssh,mosh,x2go Tier3 UI, HTCondor
kcms-t3.knu.ac.kr cms02.knu.ac.kr CentOS7 ssh,mosh,x2go Tier3 UI, HTCondor
kcms-t3.knu.ac.kr cms03.knu.ac.kr CentOS7 ssh,mosh,x2go Tier3 U, HTCondor

ssh

Linux에서 ssh로 UI에 접속하기

터미널을 열어서 원격로그인(SSH)으로 접속한다. 
$ ssh -X username@kcms-t2.knu.ac.kr( or username@cms.knu.ac.kr, username@cms01.knu.ac.kr)
$ ssh -X username@kcms-t3.knu.ac.kr( or username@cms02.knu.ac.kr, username@cms03.knu.ac.kr)

Windows OS에서 ssh로 UI에 접속하기

Windows OS 에서 linux 서버로 접속하려면 원격 로그인을 사용할 수 있는 특정 프로그램이 필요하다.
   예) Putty(무료), SSH Secure Shell Client (프리웨어 또는 정식 서비스를 찾아 설치가능) - SSH Secure Shell Client 예시 화면
또한, Event display 및 ROOT을 사용하기 위해서는 다음과 같은 X 서버를 별도로 설치하여야 한다.
   예) Xming(무료), Cygwin/X(무료), Hummingbird(유료), Xmanager(유료)
  • 첫 로그인 후 개인 Password 및 shell 설정시 유의사항
1) 패스워드 변경시 passwd 명령을 사용.
$ passwd

[주의 : 비밀번호 변경은 더이상 yppasswd 명령을 사용하지 않습니다.]

2) Login Password는 알파벳, 숫자, 특수문자 등을 섞어서 사용하여 기억하기 쉬우면서도 길게 만드는 것이 해킹방지에 도움이 됩니다.
   (간단한 단어 또는 숫자만의 조합은 극히 위험함.)
3) 계정이 발급되었을때 처음 기본 쉘은 tcsh 이다. 기본 shell의 변경은 ypchsh 명령을 이용하여 bash 혹은 zsh 등의 자신이 선호하는 shell로 변경할 수 있다.
$ ypchsh

ssh 보다 편리한 mosh

원격 데스크탑 접속이 필요하다면 x2go

JupyterHub

Computing Element, 연산 자원 사용하기

Grid 작업을 위한 CRAB Tutorial

배치 작업(HTCondor) 실행하기

HTCondor Batch System 사용법 페이지로 바로 가기

HTCondor에서 GPU 사용하기

HTCondor에서 GPU 사용하기 페이지로 바로 가기

create-batch 사용하기

create-batch 사용법으로 바로 가기

Storage Element, 데이터 저장장치 사용하기

Storage Element Tutorial

Storage Element Tutorial 페이지로 가기

xrootd 를 활용한 SE Data 사용 가이드

xrootd 를 활용한 SE Data 사용 가이드 페이지로 가기

dCache에서 WebDav 프로토콜 및 MACAROONS 인증 사용하기

dCache에서 WebDav 프로토콜 및 MACAROONS 인증 사용하기 페이지로 가기

dcap 프로토콜을 이용하여 SE 사용하기

dcap을 이용하여 SE 사용하기 페이지로 가기

CMS Dataset 전송을 위한 Rucio 사용법

Rucio 사용법 페이지로 가기

WebFTS 사용법

WebFTS 사용법 페이지로 가기

응용 소프트웨어 사용

CMSSW(CMS Software) Installation

  • CMSSW 을 설치하기 위해 먼저 설치 환경을 설정한다.
$ source /cvmfs/cms.cern.ch/cmsset_default.csh

bash shell을 사용한다면

$ source /cvmfs/cms.cern.ch/cmsset_default.sh

설치하고자 하는 버전의 CMSSW 를 확인한 후 개인 <working-directroy> 로 이동하여 설치한다. (x.y.z 는 버전을 나타낸다)

$ scramv1 list CMSSW
$ cd <working-directory>
$ scramv1 project CMSSW CMSSW_x_y_z

CVMFS에 이미 설치되어 있는 소프트웨어 사용하기

CVMFS 에서 geant4 사용하기

CVMFS 에서 geant4 사용하기 페이지로 바로 가기

CVMFS 에서 root 사용하기

CVMFS 에서 root 사용하기 페이지로 바로 가기

CVMFS에서 원하는 버전의 gcc 사용하기

CVMFS에서 원하는 버전의 gcc 사용하기 페이지로 바로 가기

CVMFS SFT repository 사용법

CVMFS SFT repository 사용법 페이지로 바로 가기

HPC를 위한 컨테이너 시스템 Singularity 사용법

Singularity 사용법 페이지로 바로 가기