JupyterHub

JupyterHub

소개

• jupyterhub는 jupyter notebook을 다중 사용자가 사용할 수 있도록 만들어진 환경입니다.
• 아래 주소를 이용하여 경북대 Tier3 jupyterhub에 접속할 수 있습니다.
• https://cms.knu.ac.kr:8000

커널

• 노트북 커널은 노트북 문서에 포함 된 코드를 실행하는 "계산 엔진"입니다.

기본 제공 커널

Python 3

• python 3.9.25

Python 3 + PyROOT

• python 3.11.9
• ROOT 6.32.02
• 주의) cvmfs 환경을 이용하기 때문에 초기 import 시 시간이 걸릴수 있습니다.

사용자 커널 추가하기

사용자 가상환경 커널 추가

• 가상환경 만들기

python3 -m venv ~/venvs/mykernel
source ~/venvs/mykernel/bin/activate
pip install --upgrade pip
pip install ipykernel numpy pandas matplotlib

• Jupyter 커널로 등록

python -m ipykernel install --user --name mykernel --display-name "Python (mykernel)"

• 확인

jupyter kernelspec list

사용자 정의 커널 추가

• 커널 디렉토리 생성

mkdir -p ~/.local/share/jupyter/kernels/python3-pyroot-user

• kernel.json 생성

cat > ~/.local/share/jupyter/kernels/python3-pyroot-user/kernel.json <<'EOF'  
{  
"argv": [  
"bash",  
"-lc",  
"source /cvmfs/sft.cern.ch/lcg/views/LCG_106/x86_64-el9-gcc13-opt/setup.sh && exec /opt/jupyterhub/user/bin/python -m ipykernel_launcher -f {connection_file}"  
],  
"display_name": "Python 3 + PyROOT (user)",  
"language": "python"  
}  
EOF

• 확인

jupyter kernelspec list

커널 삭제

jupyter kernelspec uninstall mykernel

or

rm -rf ~/.local/share/jupyter/kernels/mykernel

HTCondor Python API

• HTCondor Python API를 이용하면 jupyter 환경에서 htcondor 를 사용할수 있습니다.
• HTCondor Python Bindings Tutorials
• Submitting and Managing Jobs
• Advanced Job Submission and Management
• 위 문서중에 있는 [launch binder]를 클릭하면 해당 예제를 실습해볼수 있습니다.

ROOT

• Python ROOT

import ROOT

c = ROOT.TCanvas("c")
h = ROOT.TH1F("h","ROOT Histo;X;Y",64,-4,4)

%%cpp
h->FillRandom("gaus");
h->Draw();
c->Draw();

• https://github.com/root-project/root/tree/master/bindings/jupyroot
• PyRoot tutorials

tensorflow

• 현재 jupyterhub에서는 tensoflow cpu 만 사용할 수 있습니다.
• tensorflow gpu의 사용을 위해서는 기존과 같이 htcondor를 이용해야합니다.

기타

단축키

• Jupyter notebook 단축키 정리