From T3_KR_KNU
Contents
Torque Batch System 사용법
Tier-3 UI 접속하기
다음과 같이 터미널을 열어서 원격로그인(SSH)으로 접속합니다. 참고로 Batch Job submit은 Tier-3 UI에서만 가능합니다.
ssh -X username@kcms-t3.knu.ac.kr( or username@cms03.knu.ac.kr)
CPU 현황 확인
Batch Job을 submit 하기전 CPU 슬롯의 현황을 확인하려면 "knuinfo" 명령어를 사용합니다. cluster118.knu.ac.kr 이 Tier3 Farm의 Computing Element 입니다.
$ knuinfo
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CPU Free Total Jobs Running Waiting ComputingElement
161 39 122 122 0 cluster118.knu.ac.kr:8443/cream-pbs-cms
496 8 773 488 285 cluster50.knu.ac.kr:8443/cream-pbs-cms
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Avail Space(kB) Used Space(kB) Type SE
78367304438 754298005237 SRM cluster142.knu.ac.kr
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Job submit
Job submit을 위해서는 다음과 같이 "qsub" 명령어를 사용합니다.
qsub -q cms test.sh
Job 상태 확인
작업의 상태 확인을 위해서는 "qstat"명령을 사용합니다.
전체 작업현황을 확인하려면 다음과 같이 실행하면 됩니다.
qstat
작업들 중 자신의 작업의 상태를 확인하려면
qstat | grep `whoami`
Job 삭제
submit 한 작업을 중간에 취소하기 위해서는 "qdel" 명령을 사용합니다.
qdel <JOBID>
Job submit example 1
$ cat job_submit.sh #!/bin/bash qsub -q cms \ -o /dev/null -e /u/user/<userid>/<work_dir> \ -l walltime=48:00:00,cput=48:00:00 \ -N b-tagging \ run.sh
- "-o" 옵션은 stdout 파일이 저장될 위치를 지정합니다. default 값은 job을 submit한 현재 디렉토리입니다. stdout 파일의 확인이 불필요하다면 /dev/null로 지정하면 저장되지 않습니다.
- "-e" 옵션은 stderr 파일지 저장될 위치를 지정합니다. default 값은 job을 submit한 현재 디렉토리입니다.
- "-N" 옵션은 Batch Job 이름을 지정합니다.
- "-l walltime=72:00:00,cput=48:00:00" 옵션은 작업의 최대 실행 시간을 지정합니다.
$ cat run.sh #!/bin/bash export SCRAM_ARCH=slc5_amd64_gcc491 source /cvmfs/cms.cern.ch/cmsset_default.sh cd /cmsdas/scratch/swlee/DAS/CMSSW_7_4_6_patch6/src/CMSDAS2015/BTaggingExercise/test/ eval `scramv1 runtime -sh` cmsRun runBTaggingExerciseIPartI_cfg.py
$ ./job_submit.sh
Job submit example 2
- Job submit 스크립트 예제 파일입니다. 참고하시기 바랍니다.
http://www.physics.purdue.edu/Tier2/files/job_template_cmssw.txt http://www.physics.purdue.edu/Tier2/files/createjobs.txt
./createjobs.sh jobname #event #job #submitjob cfgfilename nameofcluster